Управление компании включает в себя систему менеджмента качества (СМК), систему экологического менеджмента и систему менеджмента безопасности труда и охраны здоровья. Системы соответствуют требованиям стандартов ГОСТ Р ИСО 9001, ГОСТ Р ИСО 14001, ГОСТ Р ИСО 45001.

Системы менеджмента компания ведет на всех этапах своей деятельности, начиная от организации маркетинга и изучения рынка, анализа контрактов, изготовления и реализации продукции до пост-обслуживания – в области выполнения инженерных изысканий, разработки проектно-сметной документации и проведения авторского надзора.

Проектный институт «АНКОР» реализовало системы менеджмента на основе принципа:
- производство и предоставление на рынок продукции и услуг такого качества (СМК), которые наилучшим образом отвечают требованиям и ожиданиям потребителей и общества, – это основа для обеспечения экономического благополучия компании и каждого работника.

В реализации систем управления в компании успешно совмещены два подхода – проектный и процессный. Процессы идентифицированы, описаны и организованы на основе программного обеспечения на собственной платформе. Здесь же встроено проектное управление в процессе разработки проектно-изыскательской документации. Средствами, обеспечивающими достижение заложенных принципов, являются имеющиеся ресурсы: созданная инфраструктура, обеспеченность необходимым оборудованием и программами, и самое ценное – компетентные, профессиональные и мотивированные специалисты.

Соблюдение требований систем менеджмента, внедрение современных и актуальных технологий управления, а также взаимодействие менеджмента компании со структурами заказчиков, регулярная подготовка и повышение квалификации руководителей и специалистов компании в Проектном институте «АНКОР» гарантирует неуклонное повышение качества реализуемой продукции.